Elle dirigeait l'institut depuis juillet 2023, mais sa position a été remise en cause après que le secrétaire à la technologie, Peter Kyle, ait ordonné à l'institut de recentrer ses travaux sur la défense et averti que son financement public pourrait être supprimé s'il ne se conformait pas à cette demande.
Cette décision a suscité un mécontentement interne et donné lieu à une plainte auprès de la Charity Commission.
Le Dr Innes a déclaré qu'elle quittait le célèbre institut alors qu'il « achève son programme de transformation actuel ».
Elle a ajouté que le moment était venu pour un « nouveau leadership » au centre.
Un porte-parole du ministère des Sciences, de l'Innovation et de la Technologie a déclaré : "Le secrétaire d'État à la Technologie a clairement indiqué que l'institut devait offrir un bon rapport qualité-prix et un impact maximal pour les contribuables, et nous continuerons à travailler pour soutenir cette ambition."